Actinomycetes from neglected areas, Iranian soil, their taxonomy, and secondary metabolites
Actinobacteria constitute the largest among 30 major phyla of Eubacteria. Actinobacteria are Gram-positive and are well known as producers of bioactive secondary metabolites, which have been utilized in medical, industrial, and agricultural applications. More than 50% of the currently described antibiotics are produced by Actinobacteria. In search of new bioactive compounds, researchers are now having to search neglected or yet undiscovered habitats. In this work, novel Actinobacteria have been isolated from various locations in Iran and neglected environments in Germany. Among those, two strains (M2T and M3) were examined for polyphasic taxonomy. Strain M2T was identified as a novel species within the genus Streptomonospora. Analysis and isolation of compounds from its extract revealed two novel thiopeptide derivatives (litoralimycins A and B). Another study identified strain 86D, isolated from Lavasan/Iran, with moderate activity against Bacillus subtilis DSM 10 and Staphylococcus aureus Newman. The polyphasic findings support that strain 86D represents a novel species in the genus Streptomyces. From the non-Streptomyces strains isolated from the soil of Iran, strain 31sw was selected for polyphasic taxonomy. The chemotaxonomy evaluation and whole-genome sequencing data supported the notion that 31sw belongs to the genus Saccharomonospora. Strain 31sw represents a potential subspecies of species Saccharomonospora xinjiangensis DSM 44391T.
Actinobakterien bilden das größte der 30 Hauptphyla der Eubakterien. Actinobakterien sind Gram-positiv und bekannt als Produzenten von bioaktiven Sekundärmetaboliten, die in der Medizin, Industrie und Landwirtschaft eingesetzt werden. Mehr als 50% der derzeit beschriebenen Antibiotika werden von Actinobakterien produziert. Auf der Suche nach neuen bioaktiven Verbindungen durchsuchen Forscher vernachlässigte oder noch unerforschte Lebensräume. In dieser Arbeit wurden neue Actinobakterien von verschiedenen Standorten im Iran und aus vernachlässigten Lebensräumen in Deutschland isoliert. Davon wurden zwei Stämme (M2T und M3) mittels der polyphasische Taxonomie untersucht. Der Stamm M2T wurde als eine neue Spezies innerhalb der Gattung Streptomonospora identifiziert. Die Analyse und Isolierung von Verbindungen aus seinem Extrakt ergab zwei neue Thiopeptidderivate (Litoralimycine A und B). Eine weitere Studie identifizierte den Stamm 86D, isoliert aus einer prober aus Lavasan/Iran, mit moderater Aktivität gegen Bacillus subtilis DSM 10T und Staphylococcus aureus Newman. Die polyphasischen Befunde unterstützen, dass Stamm 86D eine neue Spezies in der Gattung Streptomyces darstellt. Von den Nicht-Streptomyces-Stämmen, die aus dem Boden des Iran isoliert wurden, wurde der Stamm 31sw für die polyphasische Taxonomie ausgewählt. Die chemotaxonomische Auswertung und die Daten der Ganzgenomsequenzierung unterstützten die Annahme, dass 31sw zur Gattung Saccharomonospora gehört. Der Stamm 31sw repräsentiert eine potentielle Unterart der Spezies Saccharomonospora xinjiangensis DSM 44391T.
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