Bioinformatische Untersuchungen zur Evolution der Prokaryoten und Plastiden

Die Klassifizierung von Organismen und die Einordnung in hierarchische Strukturen zur Erfassung der evolutionären Beziehungen ist ein langgehegter Wunsch der Naturwissenschaftler. Das Erstellen von Abstammungsbäumen, sogenannten pyhlogenetischen Bäumen, basierte zunächst auf morphologischen Merkmalen. Aber erst die Sequenzierung und der Vergleich von genetischen Erbmaterials, wie DNA und Proteinsequenzen, ermöglichte die phylogenetische Untersuchung kleinster Organismen wie den Prokaryoten und einzelliger Eukaryoten. Phylogenetische Abstammungsbäume, wie sie in Lehrbüchern zu finden sind, wurden aus dem Vergleich einzelner Gene erstellt. Ziele dieser Arbeit waren es anhand unterschiedlicher phylogenetischer Rekonstruktionsmethoden zu untersuchen, inwieweit sich ganze Genome zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume heranziehen lassen und inwieweit es möglich ist, phylogenetisch informative Abschnitte in den untersuchten Datensätzen zu lokalisieren. Als Gegenstand der Analysen diente zum einen die Evolution der Prokaryoten. Zum anderen wurde die Evolution der Plastiden auf dem Hintergrund der Endosymbiontenhypothese beleuchtet.